分泌蛋白质组(Secretome)是指由生物体表达并分泌到细胞外空间的全部蛋白质集合。在人类中,这一蛋白质组约占整个蛋白质组的 13–20% [10.1002/pmic.200900514],其中包括细胞因子(cytokines)、生长因子(growth factors)、细胞外基质蛋白(extracellular matrix proteins)及其调控因子,以及剪切释放的受体(shed receptors)等。
“Secretome” 一词最早由 Tjalsma 等人在 2004 年提出,用以描述细胞分泌的所有因子,包括分泌途径中的组成成分[10.1128/MMBR.68.2.207-233.2004]。到 2010 年,这一概念被修订为仅包括分泌到细胞外空间的蛋白质[10.1002/pmic.200900514]。
细胞的分泌蛋白质组包括可溶性分泌蛋白以及由**剪切酶(sheddases)**蛋白水解释放的膜蛋白外部结构域(称为 sheddome)[10.1038/emboj.2012.173]。
与之相关的概念包括:
基质蛋白质组(matrisome):分泌蛋白质组中包含的细胞外基质蛋白及其相关蛋白[10.1101/cshperspect.a004903];
受体蛋白质组(receptome):包含所有膜受体的蛋白集合[10.1126/stke.2003.187.re9];
黏附蛋白质组(adhesome):包括所有参与细胞黏附的蛋白质[10.1038/ncb0807-858][10.1038/ncb3257]。
另一部分分泌蛋白通过囊泡转运(vesicle trafficking)分泌。细胞外囊泡(extracellular vesicles)包括微囊泡、外泌体及凋亡小体[10.1124/pr.112.005983]。这些囊泡携带特定的脂质、蛋白质、微小RNA(micro-RNA)和信使RNA(mRNA)等核酸:
研究显示,这两类囊泡中的因子可占分泌蛋白质组的最高 42%,因此常被统称为集合性分泌蛋白质组(collective secretome)[10.1016/j.bbapap.2013.01.022]。
应用
分泌蛋白构成了药物靶标的重要部分,是经典临床化学中关键的诊断标志物,同时也是未来精准医疗的重要潜在目标[10.1002/pmic.201100346]。
体液中的分泌糖蛋白是理想的非侵入性生物标志物来源。糖基化提高了蛋白稳定性,从而增加其可检测性[10.1074/mcp.M112.023614]。
对分泌蛋白质组的系统研究被称为 分泌蛋白组学 (Secretomics) #283。