高通量蛋白质组学 (High-throughput proteomics)

高通量蛋白质组学是指利用自动化技术和数据处理方法，对大量生物样本中的蛋白质进行快速、全面、深层次分析的技术体系。

它的核心目标是在保证检测深度和准确性的前提下，大幅度提高样本处理和数据采集的速度，以适应大规模队列研究（如临床大队列分析、药物筛选等）的需求。

当前，高通量蛋白质组学主要基于**质谱（Mass Spectrometry, MS）**技术，并结合特殊的定量策略：

技术名称	简称/英文	原理简介	高通量优势
串联质谱标记定量	TMT/iTRAQ	使用同位素标签（如TMT）对不同样本的肽段进行化学标记，然后将多个样本（如2-18个）混合后进行一次性质谱分析。	通量高：一次运行即可完成多达18个样本的定量比较，极大地缩短了机时。
数据非依赖性采集	DIA (Data-Independent Acquisition)	质谱仪系统性地扫描所有肽段的母离子和碎片离子，不依赖于特定肽段的预选择。	数据完整性高：采集信息全面，重复性好，且可减少数据采集时间。
液相色谱-质谱（LC-MS）	LC-MS	通过先进的纳流液相色谱（Nano-LC）和高分辨质谱联用，实现蛋白质组的深度鉴定和定量。	自动化：自动化进样、分离和检测，减少人工干预。

蛋白质芯片 (Protein Arrays) / ELISA 等： 使用抗体或配体点阵，同时检测样本中数百甚至数千种预选的靶标蛋白质的丰度。
- 高通量优势： 极快的检测速度，尤其适用于靶向、高通量的生物标志物筛选。