临床蛋白质组学（Clinical proteomics）是应用蛋白质组学方法对临床表型进行全系统分析，目标是系统地分析健康和疾病状态，以便在蛋白质水平上实现对疾病机制的整体理解，并发现用于预后和预测的新型蛋白质生物标志物。
临床蛋白质组学的愿景是将蛋白质组学带入临床乃至日常生活，通过监测、诊断和治疗改善个人健康。
分类
体液分析：
- 血浆蛋白质组学 (Plasma proteomics) #321
- 尿液蛋白质组学 (Urine proteomics) #320
组织切片分析
新鲜组织的蛋白质组学分析
FFPE tissue proteomics
