MaxQuant是Jürgen Cox等人开发的蛋白质组学数据处理软件包^[10.1038/nbt.1511]，旨在分析大型高分辨质谱数据集。支持多种标记技术以及无标记定量。 MaxQuant是免费软件，可以从官网下载。 • MaxQuant Summer School •
MaxQuant is written in C# and freely available. The search engine of MaxQuant is Andromeda.
Match between runs
故意不使用MBR
Q & A
LFQ Minimum ratio count
“最小比值计数”（Minimum ratio count）指在基于标记的定量分析中，对某一蛋白质进行定量所需的最少肽段特征数。[10.1038/nprot.2016.136]
LFQ min ratio count = 1 意味着只需一个肽段比值即可报告一个蛋白质比值——在大多数情况下，这种设定是更为理想的。[MaxQuant – Information and Tutorial by Tjorven Hinzke]
采用的文献
- 10.15252/msb.20199111
- 10.1074/mcp.TIR118.000900
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注
视频教程
MaxQuant Summer School： http://summerschool.maxquant.de
