人类基因组测序的结果令人惊讶，因为它揭示了我们的染色体只包含大约 20,000 个蛋白质编码基因。仅凭这个数字，我们似乎并不比微小的拟南芥 (Arabidopsis) 更复杂，并且只比线虫复杂约 1.3 倍。
基因组序列还揭示，脊椎动物几乎继承了所有来自无脊椎动物的蛋白质结构域——只有 7% 的人类已鉴定结构域是脊椎动物特有的。
然而，我们的蛋白质平均来说更复杂。在脊椎动物进化过程中，结构域重排产生了许多新颖的蛋白质结构域组合，结果是人类蛋白质中发现的结构域组合数量几乎是蠕虫或果蝇的两倍。蛋白质的这种额外多样性极大地增加了蛋白质-蛋白质相互作用的范围，但它如何促成了我们成为人类，目前尚不清楚。
